{"id":3511,"date":"2020-05-02T11:48:51","date_gmt":"2020-05-02T13:48:51","guid":{"rendered":"https:\/\/sites.usp.br\/fcfrp\/?page_id=3511"},"modified":"2020-05-06T16:33:17","modified_gmt":"2020-05-06T18:33:17","slug":"sequenciamento","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/fcfrp.usp.br\/en\/pesquisa-extensao\/pesquisa\/centrais-multiusuarios\/sequenciamento\/","title":{"rendered":"Nucleic Acid Sequencing Multi-User Laboratory (LMSeq)"},"content":{"rendered":"
\t\t\t

\"\"<\/a><\/p>\n

O Laborat\u00f3rio Multiusu\u00e1rio de Sequenciamento de \u00c1cidos Nucleicos (LMSeq) da Faculdade de Ci\u00eancias Farmac\u00eauticas de Ribeir\u00e3o Preto oferece servi\u00e7os de sequenciamento de amostras de DNA em larga escala atrav\u00e9s das plataformas Ion Torrent PGM (ThermoFischer Scientific) e MiSeq (Illumina). Oferecemos tamb\u00e9m servi\u00e7os de sequenciamento de DNA em pequena escala atrav\u00e9s do m\u00e9todo de Sanger, utilizando a plataforma 3500 Genetic Analyzer (ThermoFischer Scientific).<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Equipamentos e Servi\u00e7os<\/strong><\/h4>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

<\/div>\n
Ion Torrent PGM<\/strong><\/div>\n
A plataforma Ion Torrent PGM (ThermoFisher Scientific) tem as vantagens de oferecer leituras longas (at\u00e9 400 pb) e a possibilidade de escolha do chip de sequenciamento de acordo com o objetivo do pesquisador.
\nPreviamente ao sequenciamento, realizamos o preparo, quantifica\u00e7\u00e3o e an\u00e1lise de qualidade da biblioteca atrav\u00e9s de Bioanalyzer\u00ae e amplifica\u00e7\u00e3o por emPCR.
\nA tecnologia \u00e9 recomendada principalmente para sequenciamento de genomas e transcriptomas de microorganismos, amplicons e metagenomas.<\/div>\n

 <\/p>\n

Illumina MiSeq<\/strong><\/div>\n
Utilizando a plataforma MiSeq (Illumina), obtemos por corrida at\u00e9 15 Gb de alta qualidade, totalizando 12-25 milh\u00f5es de leituras de 2 x300 pb.
\nPreviamente ao sequenciamento, realizamos o preparo, quantifica\u00e7\u00e3o e an\u00e1lise de qualidade da biblioteca atrav\u00e9s de Bioanalyzer\u00ae.
\nA tecnologia \u00e9 recomendada principalmente para sequenciamento de genomas e transcriptomas de microorganismos, amplicons e metagenomas.<\/div>\n

 <\/p>\n

3500 Genetic Analyzer<\/strong><\/div>\n
O servi\u00e7o de sequenciamento pelo m\u00e9todo de Sanger \u00e9 realizado atrav\u00e9s do equipamento 3500 Genetic Analyzer (ThermoFischer Scientific).
\nDe acordo com a necessidade do usu\u00e1rio, nosso Laborat\u00f3rio oferece o processamento integral (rea\u00e7\u00e3o com BigDye, purifica\u00e7\u00e3o e sequenciamento) ou parcial (apenas sequenciamento) das amostras.<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Dados e Resultados<\/strong><\/h4>\n
A chave para uma boa performance no sequenciamento \u00e9 a utiliza\u00e7\u00e3o de amostras com qualidade e quantidade suficientes, o que \u00e9 responsabilidade do usu\u00e1rio. Havendo a necessidade de repeti\u00e7\u00e3o de alguma das etapas do sequenciamento devido \u00e0 baixa qualidade amostral, taxas adicionais ser\u00e3o cobradas.<\/div>\n
Para informa\u00e7\u00f5es sobre dados e resultados, entrar em contato.<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Hor\u00e1rio de Atendimento<\/strong><\/h4>\n
Segunda a Sexta-feira: das 9:00 \u00e0s 18:00 h<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Usu\u00e1rios<\/strong><\/h4>\n
A utiliza\u00e7\u00e3o dos equipamentos \u00e9 aberta preferencialmente aos docentes e alunos de p\u00f3s-gradua\u00e7\u00e3o da FCFRP-USP e demais unidades da Universidade de S\u00e3o Paulo (USP). De acordo com a disponibilidade de hor\u00e1rios, a utiliza\u00e7\u00e3o poder\u00e1 ser expandida para outros usu\u00e1rios externos, como docentes e alunos de outras institui\u00e7\u00f5es de ensino e pesquisa, al\u00e9m de laborat\u00f3rios diversos, empresas ou ind\u00fastrias interessadas.<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Localiza\u00e7\u00e3o<\/strong><\/h4>\n
Os equipamentos est\u00e3o instalados na Sala 100 do Bloco A da FCFRP-USP.<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Contato<\/strong><\/h4>\n
Emerson de Souza Santos<\/strong>
\nEmail: emerson.souza.santos@usp.br
\nTel: (16) 3315-4199<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Pagamentos<\/strong><\/h4>\n
Os valores das corridas de sequenciamento variam de acordo com a aplica\u00e7\u00e3o de interesse (DNA shotgun, transcriptoma ou amplicon) e est\u00e3o sujeitos a mudan\u00e7as conforme cota\u00e7\u00e3o do d\u00f3lar.<\/div>\n
Aos valores brutos das corridas, ser\u00e3o acrescidas taxas de servi\u00e7o de acordo com a tabela abaixo:<\/div>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Para or\u00e7amento, por favor, enviei um email para: emerson.souza.santos@usp.br<\/div>\n<\/div>\n\t\t<\/div><\/div>