O Laboratório Multiusuário de Sequenciamento de Ácidos Nucleicos (LMSeq) da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto oferece serviços de sequenciamento de amostras de DNA em larga escala através das plataformas Ion Torrent PGM (ThermoFischer Scientific) e MiSeq (Illumina). Oferecemos também serviços de sequenciamento de DNA em pequena escala através do método de Sanger, utilizando a plataforma 3500 Genetic Analyzer (ThermoFischer Scientific).
Equipamentos e Serviços
Ion Torrent PGM
A plataforma Ion Torrent PGM (ThermoFisher Scientific) tem as vantagens de oferecer leituras longas (até 400 pb) e a possibilidade de escolha do chip de sequenciamento de acordo com o objetivo do pesquisador.
Previamente ao sequenciamento, realizamos o preparo, quantificação e análise de qualidade da biblioteca através de Bioanalyzer® e amplificação por emPCR.
A tecnologia é recomendada principalmente para sequenciamento de genomas e transcriptomas de microorganismos, amplicons e metagenomas.
Previamente ao sequenciamento, realizamos o preparo, quantificação e análise de qualidade da biblioteca através de Bioanalyzer® e amplificação por emPCR.
A tecnologia é recomendada principalmente para sequenciamento de genomas e transcriptomas de microorganismos, amplicons e metagenomas.
Illumina MiSeq
Utilizando a plataforma MiSeq (Illumina), obtemos por corrida até 15 Gb de alta qualidade, totalizando 12-25 milhões de leituras de 2 x300 pb.
Previamente ao sequenciamento, realizamos o preparo, quantificação e análise de qualidade da biblioteca através de Bioanalyzer®.
A tecnologia é recomendada principalmente para sequenciamento de genomas e transcriptomas de microorganismos, amplicons e metagenomas.
Previamente ao sequenciamento, realizamos o preparo, quantificação e análise de qualidade da biblioteca através de Bioanalyzer®.
A tecnologia é recomendada principalmente para sequenciamento de genomas e transcriptomas de microorganismos, amplicons e metagenomas.
3500 Genetic Analyzer
O serviço de sequenciamento pelo método de Sanger é realizado através do equipamento 3500 Genetic Analyzer (ThermoFischer Scientific).
De acordo com a necessidade do usuário, nosso Laboratório oferece o processamento integral (reação com BigDye, purificação e sequenciamento) ou parcial (apenas sequenciamento) das amostras.
De acordo com a necessidade do usuário, nosso Laboratório oferece o processamento integral (reação com BigDye, purificação e sequenciamento) ou parcial (apenas sequenciamento) das amostras.
Dados e Resultados
A chave para uma boa performance no sequenciamento é a utilização de amostras com qualidade e quantidade suficientes, o que é responsabilidade do usuário. Havendo a necessidade de repetição de alguma das etapas do sequenciamento devido à baixa qualidade amostral, taxas adicionais serão cobradas.
Para informações sobre dados e resultados, entrar em contato.
Horário de Atendimento
Segunda a Sexta-feira: das 9:00 às 18:00 h
Usuários
A utilização dos equipamentos é aberta preferencialmente aos docentes e alunos de pós-graduação da FCFRP-USP e demais unidades da Universidade de São Paulo (USP). De acordo com a disponibilidade de horários, a utilização poderá ser expandida para outros usuários externos, como docentes e alunos de outras instituições de ensino e pesquisa, além de laboratórios diversos, empresas ou indústrias interessadas.
Localização
Os equipamentos estão instalados na Sala 100 do Bloco A da FCFRP-USP.
Contato
Pagamentos
Os valores das corridas de sequenciamento variam de acordo com a aplicação de interesse (DNA shotgun, transcriptoma ou amplicon) e estão sujeitos a mudanças conforme cotação do dólar.
Aos valores brutos das corridas, serão acrescidas taxas de serviço de acordo com a tabela abaixo:
Para orçamento, por favor, enviei um email para: emerson.souza.santos@usp.br